https://bodybydarwin.com
Slider Image

Arbre fractal interactiu de la vida s’acosta a tota la història evolutiva de la Terra

2020

Des dels protozous fins a les persones, hi ha molta vida en aquest planeta i tot està relacionat amb un avantpassat comú del qual tot descendeix. És difícil imaginar, i molt menys visualitzar, totes les coses comunes i el patrimoni compartit de tota la vida. Però ara es pot fer amb fractals.

Avui, un nou lloc web que us permetrà explorar tot l'arbre evolutiu de la vida, fer zoom i allunyar-lo com si féssiu servir un mapa en línia. Es diu OneZoom i es basa en un patró fractal que repeteix la mateixa forma de ramificació, sigui quina sigui la vostra visualització expandida o col·lapsada. James Rosindell, professor del departament de ciències de la vida a l'Imperial College London, va concebre la idea i va programar OneZoom en col·laboració amb Luke Harmon, biòleg de la Universitat d'Idaho.

El projecte va ser una mica feliç d'accident, va dir Rosindell en una entrevista. Fascinat per fractals, el biòleg evolutiu va voler utilitzar una interfície de zoom fractal per mostrar grans i complexos conjunts de dades, però va necessitar una col·laboració amb Harmon per decidir l’arbre de la vida com a subjecte.

Un arbre és una metàfora apta per a la història de la vida (entre moltes altres coses), ja que comença amb un començament clarament definit, oferint una línia de temps i un vast dossier d'informació interconnectada. En un arbre de la vida, el tronc generalment representa la primera vida a la Terra, i després es divideix en branques i branques per a diferents regnes, com plantes i animals. Les que es divideixen en branques més petites, diguem-ne de peixos, mamífers, ocells, etc. i els que es descomponen en branquetes més petites i més petites, que representen famílies i grups, i finalment surten representant espècies. Però intenteu posar tota aquesta informació en un sol arbre, i és impossible, va dir Rosindell. No cabria ni en una sola pàgina, ni en una de plantes ni en una de digital.

Rosindell va dir que això impedeix als científics i al públic apreciar plenament les connexions filogenètiques entre milions d'espècies diferents. Si bé altres científics i experts en visualització de dades han visualitzat connexions en arbre de la vida mitjançant altres formes, com anells concèntrics, Rosindell creu que un arbre amb zoom pot ser una interfície més còmoda. Va dir que es va inspirar en part en Google Maps, que ofereix una vista panoràmica, amb pocs detalls o tan pocs detalls com l'usuari vol veure.

"Va dir que una vista fractal ja té implementada aquesta opció. Va dir que no importa fins on arribeu, obteniu cada cop més informació. El que voldria fer és crear el Google Earth de la biologia ".

OneZoom té el començament, com un arbre, amb un tronc, branques, branquetes i fulles de colors. Amplieu el zoom a les primeres branques i comenceu a veure'n més detalls. Fa uns 166 milions d’anys, per exemple, veieu que els monotremes van evolucionar, seguits de marsupials i mamífers placentaris. L'arbre espiral cap al futur, cada vegada amb més branques que representen cada cop més detall. Els enllaços entre espècies serveixen una mica com les carreteres en un mapa, mostrant connexions clares. A nivell de les fulles, podeu saber quines espècies estan amenaçades d'extinció, representades per fulles vermelles i verdes, i també amb enllaços per obtenir més informació. Al final, Rosindell afegirà fotografies.

No hi ha cap límit a les metadades que pot manejar i, fins i tot, es pot veure en diferents formes fractals, des d'una espiral de Julia fins a un arbre de ploma.

Les dades provenen del projecte Open Tree of Life, una col·laboració entre biòlegs i altres científics de tot el món. Conté un valor de dècades en filogenia, història evolutiva i relacions entre grups d'organismes. Rosindell va dir un projecte aproximadament un any lluny d’un arbre complet de tota la vida. Volia un sistema al seu lloc que el pogués visualitzar tan aviat com estigui llest.

En aquest moment, OneZoom només conté mamífers, però encara són més de 5.000 espècies, totes correlacionades entre si i codificades per colors segons els seus nivells d’amenaça. Rosindell té grans plans per a la resta, i fins i tot vol construir una aplicació que es pugui cercar per a telèfons intel·ligents, mostrant la història i les relacions entre tota la vida a la Terra.

"El que voldria fer és visualitzar informació sobre cada espècie, informació sobre cada connexió, amb les seves formes intermèdies, fòssils i tota la informació meravellosa que hi ha sobre la història de la vida a la Terra en un lloc que va dir.

OneZoom estava programat per viure en directe a les 5 de la tarda a l'est hora d'avui
aquí Un article que descriu els mètodes de Rosindell i Harmon es publicarà a la sèrie "Eines fresques" de la revista d'accés obert PLOS Biology.

Aquestes massives i misterioses tempestes a Júpiter semblen totalment surrealistes

Aquestes massives i misterioses tempestes a Júpiter semblen totalment surrealistes

Els humans són els únics animals que passen per rebel·lió adolescent, però algunes espècies s’acosten

Els humans són els únics animals que passen per rebel·lió adolescent, però algunes espècies s’acosten

La Xina obre una fàbrica per construir motors per a míssils i plans espacials hipersònics

La Xina obre una fàbrica per construir motors per a míssils i plans espacials hipersònics